Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfx1P48377 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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