Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VdrP48281 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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