Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm29411-201ENSMUST00000189889 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21717-201ENSMUST00000189902 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21765-201ENSMUST00000189913 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21895-201ENSMUST00000189997 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21734-201ENSMUST00000190346 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21902-201ENSMUST00000190361 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm29029-201ENSMUST00000190520 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21898-201ENSMUST00000190727 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm29300-201ENSMUST00000190738 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20793-201ENSMUST00000190779 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28879-201ENSMUST00000190973 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21752-201ENSMUST00000191023 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm28841-201ENSMUST00000191284 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21813-201ENSMUST00000191291 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21878-201ENSMUST00000191365 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21855-201ENSMUST00000191596 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20833-201ENSMUST00000192708 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21907-201ENSMUST00000192989 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Gm20851-201ENSMUST00000193038 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm37476-201ENSMUST00000193046 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21678-201ENSMUST00000193567 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21768-201ENSMUST00000194103 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20836-201ENSMUST00000194582 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21660-201ENSMUST00000195789 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd1P40201 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Chd1P40201 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Gm20907-201ENSMUST00000185201 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms