Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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