Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NapbP28663 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NapbP28663 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NapbP28663 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms