Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZfaP23607 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms