Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou3f1P21952 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms