Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms