Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms