Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Gm2056J3QQ02 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Gm2056J3QQ02 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Gm2056J3QQ02 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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