Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3550W4VSN7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm3550W4VSN7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms