Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms