Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Pop5Q9DB28 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Pop5Q9DB28 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Pop5Q9DB28 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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