Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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