Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp4cQ9D7F7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms