Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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