Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.6 ms