Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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