Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrc9Q8CDN9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms