Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp54Q8BL06 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp54Q8BL06 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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