Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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