Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Hmbox1-209ENSMUST00000176832 1586 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.5 ms