Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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