Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms