Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.4 ms