Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms