Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms