Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms