Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srp72F8VQC1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srp72F8VQC1 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms