Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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