Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms