Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms