Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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