Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Zbed3Q9D0L1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms