Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms