Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ciao1Q99KN2 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ciao1Q99KN2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ciao1Q99KN2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ciao1Q99KN2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ciao1Q99KN2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ciao1Q99KN2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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