Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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