Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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