Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp49Q6P9L4 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp49Q6P9L4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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