Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp48Q3V0C5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms