Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms