Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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