Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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