Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zbtb38Q3LR78 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb38Q3LR78 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Zbtb38Q3LR78 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb38Q3LR78 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zbtb38Q3LR78 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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