Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms