Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin2bQ01097 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms