Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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