Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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