Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

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Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rps6ka1P18653 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rps6ka1P18653 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rps6ka1P18653 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps6ka1P18653 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms