Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms